Las comunidades autónomas, a través de sus órganos gestores, examinan las solicitudes presentadas de acuerdo con los requisitos de las ayudas. Elaboran una lista provisional con las propuestas seleccionadas y las remiten al Ministerio de Agricultura, Alimentación y Medio Ambiente.

Finalmente, la Comisión Nacional de Selección de Programas, integrada por representantes del Ministerio de Agricultura, Alimentación y Medio Ambiente y las comunidades autónomas, lleva a cabo la selección definitiva, que notifica a los beneficiarios las CCAA.